本次2010年世界杯亚洲区预选赛共有43支球队报名参加世界杯，全部预选赛分成三个阶段。

第一阶段：资格赛

首轮从10月8日开赛，按德国世界杯排名，第25位至43位的19支球队分成一组，第6至第24位的分成另一组，两组抽签后捉对进行两回合主客场淘汰赛。在晋级的19支球队中，排名靠后的八队再进行一轮淘汰赛，最终15支球队通过第一阶段资格赛。

第二阶段：20强赛

第一阶段的15队加上日、韩、沙、伊、澳五支种子队，参加11月23日在南非进行的分组抽签。20支球队将分成五个小组，每组前两名晋级下一阶段。

第三阶段：10强赛

10支参赛队分成两组，每组前两名直接晋级南非 世界杯。两个第三名进行主客场附加赛，胜者再与大洋洲冠军争夺一席。